航海学院是山东海事职业学院重点建设院系，现设有航海技术、轮机工程技术、船舶电子电气技术、安全技术与管理、水上运输与海事管理五个专业，同时开展大副、大管轮、水手、机工等16个培训项目，形成了较为完备的学历教育和培训培养体系。其中，航海技术专业是山东海事职业学院特色和优势专业，于2013年被评为“潍坊市职业院校特色品牌专业”;航海类专业群于2018年获批“山东省教育厅第三批高职院校品牌专业群建设项目”。目前，学历班在校生1200余人，社会学员700余人，年完成各类培训21000人次。

学院现拥有航海模拟器实训室、轮机模拟器实训室、航海技术实训基地、轮机工程技术实训基地、专业技能培训实训基地、水上训练中心等共12个校内实践基地，同时与中国外运长航集团重庆长江轮船公司、青岛华洋海事服务有限公司等多家航运企业签订校企合作战略协议，共建多处校外实训基地，为学生的实习/实训教学和就业创造了良好的条件。

学院现有教师60余人，专任教师53人，其中教授、副教授14人，具有船长/轮机长等船上职务的“双师型”教师41人。人才培养、科学研究与服务社会的条件优良。

2017年，在学校领导下，在全院教职工的努力下山东海事职业学院航海学院顺利通过了国家海事局船员教育和培训质量体系审核，具有无限航区船员培训的资质，为航海学院的发展开创了新的平台。